磁共振腦網絡數據處理班

發布時間:2018-10-22 14:02:28 來源: 北京賽博爾醫藥科技有限公司

北京賽博爾醫藥科技有限公司將于20181月18-- 20181月22(周四至周一)舉辦磁共振腦網絡數據處理班(詳見課表安排)。歡迎大家前來咨詢。

培訓班依然堅持小班教學,手把手帶教的教學模式,爭取使每一位參加培訓的學員能夠在數據處理方法上取得進步。

1、培訓簡介

人腦以網絡形式存在,更以網絡形式工作。人腦連接組旨在描繪人腦的結構和功能網絡連接模式,并通過揭示其內在組織規律,為理解腦認知和腦疾病提供全新見解。

當前,人腦網絡連接模式主要由多模態無創MRI數據中獲取,并在基于圖論的復雜網絡分析框架下加以解析。然而,此過程涉及繁復的圖像預處理、眾多的網絡設置和參數、復雜統計比較等,從而使得很多研究者在開展腦連接組學研究時面臨較大困難。

現在,這一切都成為過去時。北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室賀永教授團隊開發了神經影像腦連接組分析軟件—GRETNA(GraphTheoretical Network Analysis)(Wang et al.2015),該軟件囊括了當前主流的腦網絡分析方法,實現了腦網絡構建、分析、統計、作圖的自動化流水線作業,大大簡化與方便了人腦連接組學研究的開展。2015年,在國際神經科學年會上,GRETNA被MathWorks公司遴選為12個基于MATLAB的高質量神經科學工具包之一,進行重點介紹和展示。

而目前結構腦網絡也是神經計算科學里最前沿的內容,尤其基于曲面的共變網絡已經是目前國際上最前沿的課題。為此我們特增加DTI(白質纖維束)追蹤腦網絡與基于形態指標共變的腦結構網絡分析,可幫助我們理解腦功能的結構基礎,為腦疾病的臨床診斷提供穩定的結構標記物。

2、培訓對象

本次培訓班的對象是有一定的腦成像數據處理基礎,希望通過學習腦網絡數據處理方法,從而提高自己數據處理能力的學生或醫生。

培訓內容主要包括:功能磁共振數據基礎、功能連接度分析及彌散張量成像基礎,網絡構建基礎及結構、功能網絡構建與分析,腦網絡構建和分析,GRETNA講解和上機操作,PANDA講解及上機操作,基于SurfStat的腦網絡統計分析,灰質體積共變網絡分析操作,曲面形態指標共變網絡分析操作等。

注:如方便,請于會議開始前一天到達會場(9:00 - 18:00)熟悉場地及安裝軟件、拷貝資料等事宜。

3、培訓課程安排

第一天(1月18日)溫曉通上午功能網絡分析簡介和實操講解及練習11、靜息fMRI腦網絡及研究方法概括2、基于種子點和相關方法的功能連接網絡分析:結合案例進行操作練習下午功能網絡分析實操講解及練習21、Group ICA和GIFT軟件介紹2、基于GIFT軟件的Group ICA腦功能連接網絡實操練習第二天(1月19日)聶彬彬上午腦網絡構建和分析GRETNA:靜息態fMRI數據處理靜態網絡構建動態網絡構建下午GRETNA講解和上機操作(一)GRETNA:網絡屬性介紹網絡拓撲分析第三天(1月20日)聶彬彬上午GRETNA講解和上機操作(二)GRETNA:參數統計置換檢驗NBS下午GRETNA講解和上機操作(三)GRETNA:作圖BrainNet Viewer作圖第四天(1月21日)仲蘇玉上午PANDA講解及上機操作1、PANDA的預處理流程2、PANDA的網絡構建流程(節點的定義、邊的定義)3、具體上機操作下午基于SurfStat的腦網絡統計分析1、基于SurfStat的腦網絡拓撲屬性組間比較、相關分析及交互效應的統計分析;2、基于SurfStat的重復測量分析3、基于SurfStat的作圖第五天(1月22日)宋素濤   上午基于機器學習的多體元模式分析技術介紹 1、GLM vs. MVPA2、MVPA 對任務態數據進行解碼的流程與工作原理3、fMRI數據準備與上機操作下午MVPA軟件包介紹與上機操作1、LibSVM詳解與上機操作:二分類與多分類2、交叉驗證方法的實現3、ProNTo 簡介與上機操作

 

4、培訓人數

為保證培訓質量,此次培訓限定人數20人左右,報名敬請從速。

5、培訓地點

北京市經濟技術開發區科創十三街18號院鋒創科技園5號樓3A層301,具體見會議指南。

6、培訓費用

所有參會人員3000/人(含資料費、培訓費和午餐費,交通及住宿費自理)。

7、報名方式

請將報名回執發送至:[email protected]

8、繳費方式

銀行轉賬或者支付寶(賬號:13381109780 戶名:楊南),不接受現場繳費,謝絕錄像,主辦方提供發票。

9、聯系方式

聯系人:楊老師17718449506;姜老師15904965265;楊老師13381109780

 

10、備注

請各位培訓學員自帶筆記本電腦Windows 64位系統、i5、4G內存、50G剩余存儲空間等基本配置;蘋果Mac電腦用戶如方便請提前使用Bootcamp加裝Windows 64位系統);學員自己有數據的可以帶3-5例進行現場處理并在1216前進行繳費及將回執表發給姜老師,便于培訓安排。

報名回執表

單位名稱(發票抬頭,納稅人識別號) 電話號碼 科室/專業 繳費方式□轉帳  □支付寶 (請選擇在□打√)銀行信息戶名:北京賽博爾醫藥科技有限公司賬號:0200048409200117652開戶銀行:中國工商銀行股份有限公司大郊亭支行匯款備注磁共振腦網絡數據處理班  

注:請完整填寫回執表后回傳給我們,以便給你發送確認函,繳費時,請務必備注好,姓名+單位+培訓班,謝謝支持!

11、在線支持服務

參加培訓學員將得到在線技術支持服務,伴隨參加培訓班的學員共同成長。

12、培訓人員簡介:

溫曉通,男,博士,2005年于北京師范大學信息科學學院或電子與通訊系統碩士學位,2008年于北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室獲基礎心理學博士學位。同年進入佛羅里達大學生物醫學工程系從事博士后工作,后任該系研究助理科學家。主要從事注意控制和神經影像信號分析方面的研究。2013年進入中國人民大學心理學系任副教授。溫曉通博士一直致力于研究注意控制和高級認知控制的神經網絡交互機制及相應的神經信號分析方法學問題。研究涉及認知、計算機、信息、醫等多學科交叉。他的主要研究興趣是在傳統單變量分析(例如激活分析、ERP分析)的基礎上,采用新穎的多變量網絡分析方法揭示大腦各部分間的信息交互和協作控制是怎樣保證大腦健康、有序、高效的運行的。探索大腦不同腦區之間的交互作用對認識大腦認知功能神經機制、障礙都具有重要的學術價值和現實意義,是當前腦科學研究的熱點之一。經過多年積累,溫曉通博士在基于fMRI的跨腦區信息流研究以及注意控制網絡交互機制的研究方面取得了一些優秀的成果,發表在The Journal of Neuroscience 和Neuroimage等優秀期刊。

聶彬彬,中國科學院高能物理研究所,副研究員,碩士生導師,中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心副研究員,中國研究性醫院學會放射學專業青年委員會委員,中國醫藥信息學會醫學影像信息學專業委員會委員,國家自然科學基金函審專家,《磁共振成像》審稿專家等。多年來一直從事醫學影像數據分析方法的研究及應用工作,作為課題負責人承擔了國家自然科學基金三項,中國科學院青年項目一項;作為主要參與人參與了973課題兩項。發表論文十余篇。

仲蘇玉,女,博士,北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室博士后。2016年6月于北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室獲得博士學位。目前主持國家自然科學基金青年項目1項,博士后面上項目1項,并作為主要參與人參與多項國家自然科學基金項目。目前主要從事基于彌散磁共振成像的人腦白質連接組學的方法學及其應用研究。目前已在相關領域國際權威期刊共發表SCI論文13篇,其中包括以第一作者身份在CerebralCortex, Human Brain Mapping等期刊發表論文5篇,以共同作者的身份在the Journalof neuroscience等主流SCI期刊發表論文8篇。參與開發了“彌散磁共振人腦圖像的并行處理平臺”(軟件著作權登記號:2011SR091748;參與者),該軟件的相關論文目前已被引用100余次。 PANDA軟件工具包已在國際神經影像工具共享平臺上(http://www.nitrc.org/projects/panda)被下載16000余次,被國內外同行廣泛使用,得到了非常好的反饋和評價。

宋素濤,博士,濟南大學教育與心理科學學院副教授。主要關注領域為大腦狀態解碼研究與情感認知神經科學。研究基于fMRI 與 ERP 實驗技術,結合機器學習、多變量模式分析等算法開展對任務態神經影像數據的分析,構建刺激信息的正向編碼與反向解碼模型,進而對視覺及情緒性刺激加工的神經機制進行解釋。研究成果發表于 Journal of neuroscience methods, Frontiers in human neuroscience ,IEEE Transactions on Biomedical Engineering 等國際雜志。主持國家自然科學基金資助項目一項,參與國家自然科學基金項目多項。

 

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